Malária belép a genomi korszakba

LAS VEGAS - A genomikusok a legkeményebb mikrobának hívják, amelyet valaha felvettek. Most azonban egy nemzetközi csoport végre bemutatta a Plasmodium falciparum, a malária legfontosabb parazita teljes genomjának első nézetét. A genom szekvenálására irányuló, 6 évvel ezelőtt indult projekt majdnem befejeződött, és az eredményeket nyáron közzé lehet tenni.

A P. falciparum genomját, körülbelül 30 millió bázispárt 14 kromoszómán, az Egyesült Királyságban található Sanger Központ, a genomi kutatási intézet (TIGR), Rockville-ben, Marylandben, az Egyesült Államok Haditengerészetének közös erőfeszítéseivel feltörték. Kutatóközpont a Silver Spring-ben, Maryland és a Stanfordi Egyetem. A fő ok, amiért a hatéves projekt "valódi rémálommá" vált, mondja a TIGR Malcolm Gardner, az, hogy a Plasmodium DNS- é instabil, amikor baktériumban szaporodik - ez egy szükséges lépés a tényleges szekvenálás előtt -, és ezt nehéz szekvenálni. Ennek oka az, hogy a szervezet genomjának 80% -a adenint és timint tartalmaz, a DNS négy építőköve közül kettőből. (Ez az arány kb. 59% az embereknél.) Miután új technikákat és szoftvereket fejlesztettek ki ezeknek a problémáknak a leküzdésére, a csapatok szinte teljes sorrendben vannak. Alig több mint 500 rés marad fenn, ezek többsége három különösen nehéz kromoszómában van - mondta Gardner tegnap a mikrobiális genomokról szóló második konferencián.

Stewart Shuman a New York City Sloan-Kettering Intézetéből, a sok kutató közül, akik kotrották a adatokat, és új gyógyszercélokat tűz ki. Valójában a projekt "valóban fellendítette a területet, és összehozta" - mondta Dyann Wirth, a Harvard Malária Kezdeményezés igazgatója.

A bejelentés kezdete annak a kezdetenek, amely a malária-kutatás bannerévé válhat. A TIGR csapata szekvenálta a Plasmodium yoelii genomját is, amely rágcsálókban maláriát okoz, és a kevésbé veszélyes emberi parazitán, a Plasmodium vivaxon dolgozik. A Sanger Központ eközben számos más Plasmodium fajt vett be. Ezeknek a kiegészítő genomoknak segíteniük kell azonosítani, hogy mi teszi a P. falciparumot olyan halálosnak az emberek számára. Ezen felül egy másik nemzetközi konzorcium az idén is közzéteszi a legfontosabb maláriaszúnyog, az Anopheles gambiae genomi szekvenciáját.

Kapcsolódó webhelyek
A TIGR Plasmodium projektje
A Sanger Centre oldala a protozoán genomokról
PlasmoDB, egy központi adatbázis, ahol a Plasmodium szekvenciaadatokat tárolják
Tudományos történet a malária gyógyszerfejlesztéséről